Дипломатические отношения между Кыргызской Республикой и Исламской Республикой Иран были установлены 10 мая 1992 года. В 1992 году было открыто Посольство ИРИ в г.Бишкек, а в мае 1996 года - Посольство КР в г.Тегеране.

В 2002 году в Бишкеке Президентами двух стран была подписана Декларация о дружественных отношениях между Кыргызской Республикой и Исламской Республикой Иран. 

Отношения между странами получили дальнейшее развитие после обмена визитами глав государств двух стран в 2015-2016 гг. Сотрудничество происходит также в рамках международных и региональных организаций, таких как ООН, Организация Экономического Сотрудничества (ОЭС) и Организация Исламского Сотрудничества (ОИС).

Кыргызско-иранские отношения и сотрудничество развиваются поступательно, в духе взаимопонимания и взаимной поддержки.