В связи с объявлением Всемирной организацией здравоохранения пандемии коронавируса COVID-19, Министерством здравоохранения Кыргызской Республики определены дополнительные критерии оценки стран с неблагоприятной эпидемиологической ситуацией по следующим категориям:
1. Абсолютное число случаев заболевания, число летальных случаев;
2. Темпы роста распространения инфекции;
3. Глобальный индекс готовности страны к пандемии.
Таким образом, приказом Министерства здравоохранения Кыргызской Республики определены следующие три категории стран.
Категория I: Китайская Народная Республика, Итальянская Республика, Исламская Республика Иран, Республика Корея, Французская Республика, Федеративная Республика Германия и Королевство Испания.
В соответствии с решением Правительства Кыргызской Республики, для граждан иностранных государств и лиц без гражданства, которые за последние 30 дней посетили страны из категории I, введено временное ограничение на въезд на территорию Кыргызской Республики.
Лицо, нарушившее условия такой обсервации, подлежит привлечению к ответственности в соответствии с законодательством Кыргызской Республики.
Категория II: Соединенные Штаты Америки, Япония, Королевство Швеция, Швейцарская Конфедерация, Соединенное Королевство Великобритании и Северной Ирландии, Королевство Бельгия, Нидерланды.
Все иностранные граждане и лица без гражданства, прибывающие (включая транзит) из стран категории II, подлежат карантинной изоляции в домашних условиях сроком на 14 дней. 
Справочно: Ответственность за нарушение таких условий карантина установлена согласно статье 280 Уголовного Кодекса Кыргызской Республики лицо, умышлено или неосторожно нарушившие санитарно-эпидемиологические правила, причинившее по неосторожности массовое заболевание, отравление людей или иной тяжкий вред наказывается штрафом VI категории или лишением свободы II категории с лишением права занимать определенные должности либо заниматься определенной деятельностью на срок до двух лет. Также согласно статье 68 Уголовного Кодекса Кыргызской Республики размер штрафа VI категории для несовершеннолетних - от 1200 до 1400 расчетных показателей, для других физических лиц - от 2600 до 3000 расчетных показателей.
В случае, если иностранный гражданин не имеет возможности обеспечить себе домашний карантин, утвержденный приказом Министерства здравоохранения Кыргызской Республики, то он допускается на территорию Кыргызской Республики на основании решения комиссии, созданной межведомственным приказом Министерства иностранных дел (№ 43-П от 10.03.20г.), Министерства здравоохранения (№ 140 от 10.03.20г.) и Государственной пограничной службы (№163 от 10.03.20г.) Кыргызской Республики и подлежит обсервации 14 дней в специально отведенных местах.
Категория III: Республика Сингапур, Австрийская Республика, Специальный административный район КНР Гонконг, Малайзия, Королевство Дания, Королевство Бахрейн, Австралия, Греческая Республика, Канада, Республика Ирак, Объединенные Арабские Эмираты.
Все иностранные граждане и лица без гражданства, прибывающие (включая транзит) из стран категории III, подлежат наблюдению на дому с ограничением передвижения по территории Кыргызской Республики сроком на 14 дней. 
Вышеизложенные меры, в соответствии с приказом Министерства здравоохранения Кыргызской Республики, вступают в силу с 14 марта 2020 года.