Економічні відносини між Киргизькою Республікою та Україною здійснюються на основі двосторонніх угод і використання преференцій багатосторонніх договорів в рамках СНД і СОТ, що надають обом державам режим вільної торгівлі.

Експорт киргизьких товарів в Україну переважно складається зі шкіри (70,7% від загального обсягу імпорту), їстівних плодів та горіхів (14,3%), електричних машин (7,4%), засобів наземного транспорту, крім залізничного (3,5%), продуктів неорганічної хімії (2,9%), а імпорт з України представлений фармацевтичною продукцією (15,1% від загального обсягу експорту), готові продукти (13,3%), реактори ядерних, котлів, машин (10, 1%), цукру і кондитерські вироби з нього (10,0%), м'ясо та їстівні субпродукти (9,1%), какао і продуктів з нього (8,3%), електричні машини (8,3%), папір і картон (6,0%). У взаємній торгівлі традиційно переважає експорт українських товарів в КР, які формують 80% загального товарообігу. Серед країн СНД Україна займає 6-е місце (після Росії, Казахстану, Узбекистану, Таджикистану та Білорусі) за обсягом експорту товарів в КР і 13-е місце за обсягами експорту товарів в Киргизстан серед всіх країн світу (після КНР, РФ, Казахстану, Великобританії, Туреччини, Узбекистану, США, ФРН, Литви, Таджикистану, Індії та Білорусії).

Одним з ключових механізмів щодо розширення двостороннього партнерства є Міжурядова киргизько-українська спільна комісія з торговельно-економічного, науково-технічного і культурного співробітництва, 1-е засідання якої відбулося 27-28 березня 2003 року в м.Київ, друге - 14-15 травня 2007 року в м.Бішкек, а третє - 4 липня 2013 р. в м.Київ Головою киргизької частини МПК є міністр економіки КР, а української частини - міністр соціальної політики України.

Здійснюється постійна взаємодія між діловими колами двох країн. Зокрема, 22 вересня 2016 року в м.Бішкек за підтримки Асоціації молодих підприємців КР і Торгово-промислової палати КР відбувся киргизько-український бізнес-форум, а 3 липня 2018 року в Києві проведено киргизько-український бізнес-форум, організований за ініціативою Посольства КР в Україні та Торгово-промислових палат двох країн.